El poder de la Lanza de Longinus decidirá el futuro del mundo.
La Tierra estaba siendo «estrangulada» a causa de las calamidades provocadas por la Lanza de Longinus, mientras que, en cambio, la Luna se expandió. El Yomotsu Hirasaka, un fragmento que se desprendió de ella a causa de la rápida transferencia de material de la corteza terrestre, empezó a descender hacia la Tierra siguiendo un rumbo de colisión directa. Mientras el planeta se ve sacudido por este nuevo peligro, Shinji y el Super EVA lanzan un disparo con el arco largo Azumaterasu para derribar el asteroide, pero acaban convertidos en sal justo después y desaparecen...
Los gigantes se reúnen sobre el fragmento lunar siguiendo la copia de la Lanza de Longinus que se estrelló contra él. ¿Quién de todos se hará con ella tras la batalla? ¿Y podrá Shinji regresar de nuevo a la vida?
Esta es la historia de una posibilidad alternativa de Evangelion nacida a partir del episodio 24 de la serie animada, y revivida tras diez años de su publicación original.