Taki, un estudiante de bachillerato de Tokio, empieza a intercambiarse a través de sus sueños con Mitsuha, otra estudiante que vive en una zona rural. Taki trata de adaptarse lo mejor que puede a la vida en un pueblo del que no sabe nada, y sobre todo a un cuerpo de mujer que le es ajeno, para que no se descubra el intercambio en la vida de ambos.
Con el paso del tiempo, Taki nota que la Mitsuha de la que hablan los habitantes del pueblo no es igual que la Mitsuha que él conoce a través de los mensajes que se dejan cada vez que ocupan sus respectivos cuerpos y empieza a sentir curiosidad por conocerla en persona.